MirGeneDB ID | Mmr-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2355 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2355 Cfa-Mir-2355 Cja-Mir-2355 Cpo-Mir-2355 Dno-Mir-2355 Ete-Mir-2355 Hsa-Mir-2355 Laf-Mir-2355 Mml-Mir-2355 Ocu-Mir-2355 Pab-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007668.1: 29511076-29511142 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCCCGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCAUAGAAAAUAGCAUUGUCAGACGCAUCAUCCCCGGAUACAAUGGACAAUAUGCUGUUAUAAUUGUACUGCAUUGUCCUUGCUGUUUGGAGAUAAUACUGCUGACUUUAUUCCUCAGUACGUGACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCAUAGAAAAUAGCAUU-- ACGC C C -| U AUGCUGUUAU GUCAG AU AUC CCGGAUA CAA GGACAAU \ CAGUC UA UAG GGUUUGU GUU CCUGUUA A CAGUGCAUGACUCCUUAUUU GUCA A A C^ - CGUCAUGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-2355_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUCCCCGGAUACAAUGGACAAUAU -24
Get sequence
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Co-mature sequence | Mmr-Mir-2355_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- CAUUGUCCUUGCUGUUUGGAGAUAA -67
Get sequence
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