MirGeneDB ID | Dno-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2355 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2355 Cfa-Mir-2355 Cja-Mir-2355 Cpo-Mir-2355 Ete-Mir-2355 Hsa-Mir-2355 Laf-Mir-2355 Mml-Mir-2355 Mmr-Mir-2355 Ocu-Mir-2355 Pab-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH567858: 616793-616859 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCAUAGAAAAUAACAUUGUCAAGCGUGUCAUCCCCAGAUGCAAUGGACAAUAUGCUAUUAUGAUUGUAUGGCAUUGUCCUUGGUGUUUGGAGAUAAUACUGCUGACAUUAUUCCUCUCAUACAUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCAUAGAAAAUAACAU--| A - C C AAU AUGCUAUUAU UGUCA GC GUGU AUC CCAGAUGC GGACAAU \ ACAGU CG CAUA UAG GGUUUGUG CCUGUUA G UGUACAUACUCUCCUUAUU^ - U A A GUU CGGUAUGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-2355_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUCCCCAGAUGCAAUGGACAAU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Dno-Mir-2355_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
45- UGUCCUUGGUGUUUGGAGAUAA -67
Get sequence
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