MirGeneDB ID | Ete-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2355 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2355 Cfa-Mir-2355 Cja-Mir-2355 Cpo-Mir-2355 Dno-Mir-2355 Hsa-Mir-2355 Laf-Mir-2355 Mml-Mir-2355 Mmr-Mir-2355 Ocu-Mir-2355 Pab-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (echTel2) |
JH980302: 33329502-33329568 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCGUGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCAUGGAAAAUAACAUUGUCAGCCGUGUCAUCGUGAGAGACAAUGGACAAUAUGCUAUGAUAAUUGUAUGGCAUUGUCCUUGGUGUUUGGCGAUAGUAUUGCUGACGUUAUCCCUCUCGUACAUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCAUGGAAAAUAACAU--| C UC G G AAU AUGCUAUGAU UGUCAGC GUG AUCGU AGA AC GGACAAU \ GCAGUCG UAU UAGCG UUU UG CCUGUUA A UGUACAUGCUCUCCCUAUU^ U GA G G GUU CGGUAUGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Ete-Mir-2355_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUCGUGAGAGACAAUGGACAAU -22
Get sequence
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Star sequence | Ete-Mir-2355_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
45- UGUCCUUGGUGUUUGGCGAUAG -67
Get sequence
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