MirGeneDB ID | Cpo-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2355 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2355 Cfa-Mir-2355 Cja-Mir-2355 Dno-Mir-2355 Ete-Mir-2355 Hsa-Mir-2355 Laf-Mir-2355 Mml-Mir-2355 Mmr-Mir-2355 Ocu-Mir-2355 Pab-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_13: 40713701-40713767 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCUCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAGAAAAUAACAUUGUCAGUCAGCCACGCUGUCCUCAGAUACAAUGGACAAUAUGCUAUUAUAAUUGCACGGCAUUGUCCUUGCUGUUUGGAGAUAAUACUGUUGACAGUAUUCCUCUCAUACAUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UAGAAAAUAACAUUGUCA-- CACGC CU -| U AUGCUAUUAU GUCAGC UGUC CAGAUA CAA GGACAAU \ CAGUUG AUAG GUUUGU GUU CCUGUUA A UGUACAUACUCUCCUUAUGA UCAUA AG C^ - CGGCACGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpo-Mir-2355_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUCCUCAGAUACAAUGGACAAU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Cpo-Mir-2355_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
45- UGUCCUUGCUGUUUGGAGAUAA -67
Get sequence
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