| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-506-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-506-P4 Mmu-Mir-506-P11a Mmu-Mir-506-P11b1 Mmu-Mir-506-P11b2 Mmu-Mir-506-P11c1 Mmu-Mir-506-P11c2 Mmu-Mir-506-P11d Mmu-Mir-506-P12 Mmu-Mir-506-P13 Mmu-Mir-506-P14 Mmu-Mir-506-P15 Mmu-Mir-506-P16 Mmu-Mir-506-P17 Mmu-Mir-506-P18 Mmu-Mir-506-P19 Mmu-Mir-506-P20 Mmu-Mir-506-P21 Mmu-Mir-506-P22 Mmu-Mir-506-P23 Mmu-Mir-506-P24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-506-P2b1 Bta-Mir-506-P2b2 Cfa-Mir-506-P2b Cpo-Mir-506-P2b Dno-Mir-506-P2b Eca-Mir-506-P2b3 Eca-Mir-506-P2b4 Hsa-Mir-506-P2b Laf-Mir-506 Mml-Mir-506-P2b Mmr-Mir-506-P2b Pab-Mir-506-P2b Rno-Mir-506-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 67988383-67988440 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P2b) |
Mir-506-P4
chrX: 67988099-67988156 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P2b chrX: 67988383-67988440 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UUGGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCACCUUCACUCAUGUAGUGUGUGAUGUAUCACUUGAGGAUGUACCACCCAUUUAACAGGAAACAUGCUUGGUACAUCUUUGAGUGAGAUAACACACAACAGCUACCACCUCAAUACUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCACCUUCACUCAUGUAG--| A A UG CC UUUAAC UGUGUG UGU UCACU AGGAUGUACCA CA A ACACAC AUA AGUGA UUCUACAUGGU GU G UCAUAACUCCACCAUCGACA^ A G GU UC ACAAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-506-P2b_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CACUUGAGGAUGUACCACCCA -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-547-5p miRDB: MIMAT0017210 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-506-P2b_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CUUGGUACAUCUUUGAGUGAG -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003173 TargetScanVert: mmu-miR-547-3p miRDB: MIMAT0003173 |
