MirGeneDB ID | Mmr-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95 Cfa-Mir-95 Cja-Mir-95 Cpo-Mir-95 Dno-Mir-95 Eca-Mir-95 Hsa-Mir-95 Laf-Mir-95 Mml-Mir-95 Pab-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007678.1: 36142827-36142883 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUAGGAUCGUGACGCUCAACACAGUGGGCGCUCAAUAAAUGUCUGUUGAAUUGAGAUGCGUUAAAUUCAACGGGUAUUUAUUGAGCACCCACUCUGUGCCAGACGCUGAGCCGGGCGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GUAGGAUCGUGACGCUCA--| C C GU GAGAU ACA AGUGGG GCUCAAUAAAU CUGUUGAAUU \ UGU UCACCC CGAGUUAUUUA GGCAACUUAA G GCGGGCCGAGUCGCAGACCG^ C A UG AUUGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-95_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCAAUAAAUGUCUGUUGAAUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-95_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UUCAACGGGUAUUUAUUGAGCA -57
Get sequence
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