MirGeneDB ID | Cpo-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95 Cfa-Mir-95 Cja-Mir-95 Dno-Mir-95 Eca-Mir-95 Hsa-Mir-95 Laf-Mir-95 Mml-Mir-95 Mmr-Mir-95 Pab-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_166: 785836-785892 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAAUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGGGGACUGUGAUGCUUAGCACAGUGGGCGCUCAAUAAAUGUUGGUUGAAUUAAGCUGCGUUAAAUUCAAUGGGUAUUUACUGAGCCCUCACUCUGUGCCAGACACUGAGAGGGAUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGGGGACUGUGAUGCUUA --| C A G AAGCU GCAC AGUGGG GCUCA UAAAUGUU GUUGAAUU \ CGUG UCACUC CGAGU AUUUAUGG UAACUUAA G CUAGGGAGAGUCACAGAC UC^ C C G AUUGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cpo-Mir-95_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0046935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCAAUAAAUGUUGGUUGAAUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Cpo-Mir-95_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0046936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UUCAAUGGGUAUUUACUGAGCC -57
Get sequence
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