MirGeneDB ID | Laf-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95 Cfa-Mir-95 Cja-Mir-95 Cpo-Mir-95 Dno-Mir-95 Eca-Mir-95 Hsa-Mir-95 Mml-Mir-95 Mmr-Mir-95 Pab-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010045.1: 239252-239308 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUAGGACUGUGACACUCAACACCGUGGGCACUCAAUAAAUGUUUGUUGAAUUGAGAUGCAUUGAAUUCAACGGGUAUUUAUCGAGCACCCACUCUGUGCCAGACUCUGUACUAGGUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GUAGGACUGUGACACUCA--| CC CA A UU GAGAU ACA GUGGG CUC AUAAAUG UGUUGAAUU \ UGU CACCC GAG UAUUUAU GCAACUUAA G GUGGAUCAUGUCUCAGACCG^ CU AC C GG GUUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Laf-Mir-95_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCAAUAAAUGUUUGUUGAAUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Laf-Mir-95_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UUCAACGGGUAUUUAUCGAGCA -57
Get sequence
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