MirGeneDB ID | Mmr-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-574 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-574 Cfa-Mir-574 Cja-Mir-574 Cpo-Mir-574 Dno-Mir-574 Eca-Mir-574 Ete-Mir-574 Hsa-Mir-574 Laf-Mir-574 Mml-Mir-574 Mmu-Mir-574 Ocu-Mir-574 Pab-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007679.1: 82589549-82589605 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACGCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGGCCGAGGGCCCGCGUGCGCGCGGGCGUGUGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUGUCGCUCGGGUCCACGCUCAUGCACACACCCGCACGCCCGCGCGCCGGCUCUGCCCCCUCGGCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CGGCCGAGGGCCCGCGU--| AGU UGUCGC GCGCGCGGGCGUGUG GUGUGUGUGUGAGUGUG \ CGCGCGCCCGCACGC CACACACGUACUCGCAC U CCGGCUCCCCCGUCUCGGC^ C-- CUGGGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-574_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUG -24
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-574_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CACGCUCAUGCACACACCCGCA -57
Get sequence
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