MirGeneDB ID | Mmr-Mir-3085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3085 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-3085 Cfa-Mir-3085 Cja-Mir-3085 Cpo-Mir-3085 Dno-Mir-3085 Ete-Mir-3085 Hsa-Mir-3085 Laf-Mir-3085 Mml-Mir-3085 Mmu-Mir-3085 Ocu-Mir-3085 Pab-Mir-3085 Rno-Mir-3085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007675.1: 48158912-48158972 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUCUACGCAGUCACCAGCCCUGCUCUGGGAAGGUGCCAUUCUGAGGGCCAGGAGUUUGAUUACGUGUCACUCUGGCUGCUAUGGCCCCCUCCUAGGGUCCGGGCGUCACACCCAGACCAGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AUCUACGCAGUCACCAG- U-| A U UCUGAG G UUUGAUU CCC GCUCUGGGA GG GCCAU GGCCAG AG \ GGG UGGGAUCCU CC CGGUA UCGGUC UC A UGACCAGACCCACACUGC CC^ C C UCG--- - ACUGUGC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-3085_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGUGCCAUUCUGAGGGCCAGGAG -24
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-3085_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UCUGGCUGCUAUGGCCCCCUC -61
Get sequence
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