| MirGeneDB ID | Dno-Mir-3085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3085 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-3085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-3085 Cfa-Mir-3085 Cpo-Mir-3085 Ete-Mir-3085 Hsa-Mir-3085 Mml-Mir-3085 Mmu-Mir-3085 Ocu-Mir-3085 Rno-Mir-3085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH567359: 2867179-2867239 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUCGCCCGGUUGCCAGUCCGGCUCUGGGAAGGUGCCAUUCCGAGGGCCAGGAGUUGGAUUAUGUGUCACUCUGGCUGCUCUGGCCCCCUCCCAGGGUCUGGGCAUCACUCCCAGGCCAGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUCGCCCGGUUGCCAG- -| A U UUCC - G UGGAUU UCCGG CUCUGGGA GG GCCA GAG GGCCAG AGU \ GGGUC GGGACCCU CC CGGU CUC UCGGUC UCA A CGACCGGACCCUCACUAC U^ C C ---- G - CUGUGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-3085_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUGCCAUUCCGAGGGCCAGGAGU -25
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-3085_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UCUGGCUGCUCUGGCCCCCUC -61
Get sequence
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