| MirGeneDB ID | Mml-Mir-362-P3a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-500a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-362-P3b Mml-Mir-362-P4 Mml-Mir-362-P5 Mml-Mir-362-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-362-P3a-v1 Cfa-Mir-362-P3a-v1 Cja-Mir-362-P3a-v1 Dno-Mir-362-P3a-v1 Eca-Mir-362-P3a-v1 Hsa-Mir-362-P3a-v1 Mmr-Mir-362-P3a-v1 Ocu-Mir-362-P3a Pab-Mir-362-P3a-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 49797348-49797409 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P3a-v1) |
Mir-188-P1
CM014356.1: 49792095-49792153 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-188-P2 CM014356.1: 49792448-49792507 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v1 CM014356.1: 49797348-49797409 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v2 CM014356.1: 49797348-49797409 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P4 CM014356.1: 49797871-49797929 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3b CM014356.1: 49801117-49801177 [+] UCSC Ensembl Mir-188-P3 CM014356.1: 49803687-49803745 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P6 CM014356.1: 49805039-49805098 [+] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mml-Mir-362-P3a-v1 |
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| Seed | AUGCACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCAGGGCUUUGUGCUCUGCUCCCCCUCUCUAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGUGCUAUCUGAAUGCAAUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGAGAGCGAGAGCUUCAUCUUCAUGUAGGACAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGCAGGGCUUUGUGCUCU-- CCC U-| UAC UG AGA- GCUAU GCUC CUCUC AAUCCUUGC C GGUG GU \ CGAG GAGAG UUAGGAACG G CCAC CG C GACAGGAUGUACUUCUACUU AGC UC^ --- GU GUAA UAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-362-P3a-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGU -25
Get sequence
|
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-500a-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-362-P3a-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0026888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGA -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-500a-3p |
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| Variant | Mml-Mir-362-P3a-v2 |
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| Seed | UGCACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCAGGGCUUUGUGCUCUGCUCCCCCUCUCUAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGUGCUAUCUGAAUGCAAUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGAGAGCGAGAGCUUCAUCUUCAUGUAGGACAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGCAGGGCUUUGUGCUCU-- CCC U-| UAC UG AGA- GCUAU GCUC CUCUC AAUCCUUGC C GGUG GU \ CGAG GAGAG UUAGGAACG G CCAC CG C GACAGGAUGUACUUCUACUU AGC UC^ --- GU GUAA UAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-362-P3a-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGU -25
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-500a-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-362-P3a-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0026888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGA -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-500a-3p |
