MirGeneDB ID | Mml-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1912 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1912 Cfa-Mir-1912 Cja-Mir-1912 Cpo-Mir-1912 Eca-Mir-1912 Ete-Mir-1912 Hsa-Mir-1912 Laf-Mir-1912 Mmr-Mir-1912 Mmu-Mir-1912 Ocu-Mir-1912 Pab-Mir-1912 Rno-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 111202571-111202625 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1912) |
Mir-1912
CM014356.1: 111202571-111202625 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 CM014356.1: 111203690-111203752 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | ACCCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCACAACUAGACUUGGCUCUAGGAUGUGCUCAUUGCAUGGGCUGUGUAUAUUAUUAUUCAAUACCCAGAGCGUGCAGUGUGAACAUUAAAUAGAGAUUGAAAGACAGCCAGGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UAUCACAACUAGACUUGG G--| GCU GG U AUUAU CUCUA GAUGU CAUUGCAUG CUG GUAU \ GAGAU UUACA GUGACGUGC GAC CAUA U AGGACCGACAGAAAGUUA AAA^ AGU GA C ACUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-1912_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCAUUGCAUGGGCUGUGUAUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-1912_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- UACCCAGAGCGUGCAGUGUGAA -55
Get sequence
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