MirGeneDB ID | Bta-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1912 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-1912 Cja-Mir-1912 Cpo-Mir-1912 Eca-Mir-1912 Ete-Mir-1912 Hsa-Mir-1912 Laf-Mir-1912 Mml-Mir-1912 Mmr-Mir-1912 Mmu-Mir-1912 Ocu-Mir-1912 Pab-Mir-1912 Rno-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037357.1: 62991615-62991669 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1912) |
Mir-1912
NC_037357.1: 62991615-62991669 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 NC_037357.1: 62992996-62993058 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | ACCCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUCACAACUGGACUUGGCUCUAGGAUGUGCUCAUUGCAUGAGCUGUGUAUAUUGUUAUUCCAUACCCAGAGCGUGCAGUGUGAACAUAAUAGAGAUUGAAAGACAGCAAGAAGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGUCACAACUGGACUUGG--| GG GCU AG U AUUGU CUCUA AUGU CAUUGCAUG CUG GUAU \ GAGAU UACA GUGACGUGC GAC CAUA U GGAAGAACGACAGAAAGUUA^ AA AGU GA C CCUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bta-Mir-1912_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCAUUGCAUGAGCUGUGUAUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Bta-Mir-1912_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- UACCCAGAGCGUGCAGUGUGAA -55
Get sequence
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