| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-7370 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Neu-Mir-7370 Sha-Mir-7370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
X: 38866830-38866888 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7370) |
Mir-7370
X: 38866830-38866888 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7371-P1 X: 38895437-38895494 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P2a X: 38896648-38896704 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P3 X: 38897274-38897334 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P4 X: 38897921-38897979 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P5 X: 38898553-38898610 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P6 X: 38899297-38899358 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P7 X: 38901020-38901081 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P8-v1 X: 38901553-38901612 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P8-v2 X: 38901553-38901612 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P2b X: 38902124-38902180 [-] UCSC Ensembl Mir-7371-P9 X: 38902981-38903043 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGGAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCUUUCUUCGAUCCCUUCCAGUUGCUCCUUUCACACCAGAUGCUCCCUUUUGUGAAUUCUGUAAAAAGGGAUAUCCUGUGUGAAAGGAGUUGCUAGGGCCAAAUCCCUCGGCAGGAAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAUCUUUCUUCGAUCCCU- -| U CA C GUGAA UCC AGU GCUCCUUUCACAC GAUG UCCCUUUU U GGG UCG UGAGGAAAGUGUG CUAU AGGGAAAA U AAGGACGGCUCCCUAAACC A^ U UC - AUGUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mdo-Mir-7370_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0028762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUCACACCAGAUGCUCCCUUUU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7370-5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mdo-Mir-7370_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0028763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAGGGAUAUCCUGUGUGAAAGG -59
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7370-3p |
