| MirGeneDB ID | Hru-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Red Abalone (Haliotis rufescens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hru-Mir-10-P1 Hru-Mir-10-P2 Hru-Mir-10-P3 Hru-Mir-10-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Adi-Mir-10 Agr-Mir-10-P6 Asp-Mir-10 Cte-Mir-10-P6 Eba-Mir-10-P6 Efe-Mir-10-P6 Esc-Mir-10-P6 Lgi-Mir-10-P6 Lhy-Mir-10-P6 Mgi-Mir-10-P6 Mom-Mir-10-P6 Npo-Mir-10-P6 Nve-Mir-10 Obi-Mir-10-P6 Ofu-Mir-10-P6 Ovu-Mir-10-P6 Pve-Mir-10-P6 Rph-Mir-10-P6 War-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eumetazoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_023055435.1_xgHalRufe1.0.p_genomic_plus_traces) |
JALGQA010000004.1: 47418182-47418242 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUACCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGGAAUGUUUACGUGAGGCUGCCCUGUGGACUUACCCUGUUAAUCGGAGAAGUGCUAUGAGCUCCCUGCUUCUCGUUUCACAGGGUAUAUUUGCCGGGCAGUAAUAACAUCGAGCUGACGAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGGAAUGUUUACGUGAG--| U UG CU U UCG GCUAUG GCUGCCC G GA UACCCUGU AA GAGAAGU A UGACGGG C UU AUGGGACA UU CUCUUCG G AGCAGUCGAGCUACAAUAA^ C GU AU C UG- UCCCUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Hru-Mir-10-P6_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUACCCUGUUAAUCGGAGAAGU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Hru-Mir-10-P6_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUCUCGUUUCACAGGGUAUAUU -61
Get sequence
|
