MirGeneDB ID | Ete-Mir-672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-672 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-672 Cpo-Mir-672 Dno-Mir-672 Laf-Mir-672 Mmr-Mir-672 Mmu-Mir-672 Ocu-Mir-672 Rno-Mir-672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (echTel2) |
JH980401: 2575282-2575341 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUACAAGAUGGUGAUUUAGCCCUUUAGUUUUGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGAGUACAUAUAUUUAUCACACACAGUCACUAUCUUCGAAAGUGAGGGUGCACAUCUUUCUGAGCCAUCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUACAAGAUGGUGAUUUA- -| G U U GUACAU GC CCUUUA UUUUGAGG UGGUG ACUGUGUGUGA \ CG GGGAGU AAAGCUUC AUCAC UGACACACACU A UCUACCGAGUCUUUCUACA U^ G U - AUUUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Ete-Mir-672_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGUUGGUGUACUGUGUGUGA -23
Get sequence
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Star sequence | Ete-Mir-672_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- ACACACAGUCACUAUCUUCGAA -60
Get sequence
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