| MirGeneDB ID | Ete-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-483-v1 Cfa-Mir-483 Cja-Mir-483 Cpo-Mir-483 Dno-Mir-483 Eca-Mir-483-v1 Hsa-Mir-483 Mml-Mir-483 Mmr-Mir-483 Mmu-Mir-483 Neu-Mir-483 Ocu-Mir-483 Pab-Mir-483 Rno-Mir-483 Sha-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980433: 1921138-1921200 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGACGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCAGCUGAGCUGCCCUGGGGGAGGGGGAGAGGACGGGAGGAGAGUAGGGCGUGGUCUUAUCCAACUUCCUCACUCCUCUCCUCCUGUCUUUUCUCCCCCGCCCGCCUGCCCACCCACCCGCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCCAGCUGAGCUGCCCU-- -| A U - CGUGGUCUU GGG GG GGGGGAGAGGACGGGAGGAGAG AG GG A CCC CC CCCUCUUUUCUGUCCUCCUCUC UC CU U CCGCCCACCCACCCGUCCG G^ - C A CCUUCAACC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-483_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGACGGGAGGAGAGUAGGGCG -22
Get sequence
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| Star sequence | Ete-Mir-483_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CACUCCUCUCCUCCUGUCUUUU -63
Get sequence
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