| MirGeneDB ID | Dya-Mir-956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-956 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-956-v1 Dme-Mir-956-v1 Dmo-Mir-956-v1 Dsi-Mir-956-v1 Gpa-Mir-956-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Glossinidae + Drosophilidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Glossinidae + Drosophilidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 11795685-11795813 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-956-v1) |
Mir-314
3L: 11794919-11795006 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-956-v1 3L: 11795685-11795813 [-] UCSC Ensembl Mir-956-v2 3L: 11795685-11795813 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Dya-Mir-956-v1 |
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| Seed | UUCGAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAUAUGUGCACUUUUCCUGAUCGUUAUCGUGUUUGGAAUGGUCUCGUUAGCUAACGGAUGAGCAAGUGCUCGGCUCACUGGCCCAAAUGCAGUUUGCCCGGAGGAGCCGGUUUACCCAGCACUCAAGUGUGUAGUUUCGAGACCACUCUAAUCCAUUGCACCAUUUUCCACUAUAUGCAAAUUCGCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 80 90 UUGAUAUGUGCACUUUUCCUGAUCGUUAUC ------| A UU AACGGAUGAGCAAGUGCUCGGCUCACUGGCCCAAAUGCA GUGU UUGGA UGGUCUCG AGCU G CACG AAUCU ACCAGAGC UUGA U CCGCUUAAACGUAUAUCACCUUUUAC---- UUACCU^ C U- UGUGUGAACUCACGACCCAUUUGGCCGAGGAGGCCCGUU 180 170 160 150 140 130 120 110 100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dya-Mir-956-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGUUUGGAAUGGUCUCGUUAGCU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dya-Mir-956-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
106- UUUCGAGACCACUCUAAUCCAUU -129
Get sequence
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| Variant | Dya-Mir-956-v2 |
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| Seed | UCGAGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAUAUGUGCACUUUUCCUGAUCGUUAUCGUGUUUGGAAUGGUCUCGUUAGCUAACGGAUGAGCAAGUGCUCGGCUCACUGGCCCAAAUGCAGUUUGCCCGGAGGAGCCGGUUUACCCAGCACUCAAGUGUGUAGUUUCGAGACCACUCUAAUCCAUUGCACCAUUUUCCACUAUAUGCAAAUUCGCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 80 90 UUGAUAUGUGCACUUUUCCUGAUCGUUAUC ------| A UU UAACGGAUGAGCAAGUGCUCGGCUCACUGGCCCAAAUGCA GUGU UUGGA UGGUCUCG AGC G CACG AAUCU ACCAGAGC UUG U CCGCUUAAACGUAUAUCACCUUUUAC---- UUACCU^ C U- AUGUGUGAACUCACGACCCAUUUGGCCGAGGAGGCCCGUU 180 170 160 150 140 130 120 110 100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dya-Mir-956-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGUUUGGAAUGGUCUCGUUAGC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dya-Mir-956-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
107- UUCGAGACCACUCUAAUCCAUU -129
Get sequence
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