MirGeneDB ID | Dya-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-314 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-314 Dme-Mir-314 Dmo-Mir-314 Dsi-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 11794919-11795006 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-314) |
Mir-314
3L: 11794919-11795006 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-956-v1 3L: 11795685-11795813 [-] UCSC Ensembl Mir-956-v2 3L: 11795685-11795813 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUUCGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUAGCAGUGUUUUGGCCCGCACUCUUAUCGUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACCUAGUUGAGGAAAAACCCCAUGUCGGAUUUUGUUACCUCUGGUAUUCGAGCCAAUAAGUUCGGCCACGAAUUCGCAUUUUAUCUUUUGCAUUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UAUAGCAGUGUUUUGGCCC AC-- UUA-| U G U AU UAGUUGAGGAAAAACCCCA GC UC UCG AACUUGU UGGCU CGA GUACC \ CG AG GGC UUGAAUA ACCGA GCU UAUGG U UUUACGUUUUCUAUUUUA- CUUA CACC^ - - - -- UCUCCAUUGUUUUAGGCUG 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-314_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACC -26
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-314_3p |
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mirBase accession | MIMAT0009077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
67- UAUUCGAGCCAAUAAGUUCGG -88
Get sequence
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