| MirGeneDB ID | Dmo-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-314 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dmo-mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-314 Dme-Mir-314 Dsi-Mir-314 Dya-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6680: 18619774-18619866 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-314) |
Mir-314
scaffold_6680: 18619774-18619866 [+]
Ensembl
Mir-956-v1 scaffold_6680: 18620895-18620985 [-] Ensembl Mir-956-v2 scaffold_6680: 18620895-18620985 [-] Ensembl |
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| Seed | AUUCGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUGAAGGUGUUUUAGGUCGGGCUCUUAUCGUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACCUCGUCGAGCGAAAAGCGAAUUCAUUGUUGGAUUUUGUUGCUCUUGGUAUUCGAGCCAAUAAGUUCGGCAACCAGUUCGCAUUUUAUCUUUUGCAGUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UAUGAAGGUGUUUUAGGU- C-| AU U G U AU UCGUCGAGCGAAAAGCGAAUU CGGGCU UU CG AACUUGU UGGCU CGA GUACC C GCUUGA AA GC UUGAAUA ACCGA GCU UAUGG A UUGACGUUUUCUAUUUUAC CC^ CG - - - -- UUCUCGUUGUUUUAGGUUGUU 150 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-314_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACC -26
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-314_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
72- UAUUCGAGCCAAUAAGUUCGG -93
Get sequence
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