| MirGeneDB ID | Dme-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-314 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-314 Dmo-Mir-314 Dsi-Mir-314 Dya-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3L: 11773014-11773101 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-314) |
Mir-314
3L: 11773014-11773101 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-956-v1 3L: 11773740-11773868 [-] UCSC Ensembl Mir-956-v2 3L: 11773740-11773868 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUUCGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUAGCAGUGUUUUGGCCCGCACUCUUAUCGUAACUUGUGUGGCUUCGAACUUACCUAGUUGAGGAAAACUCCCAUGUCGGAUUUUGUUACCUCUGGUAUUCGAGCCAAUAAGUUCGGCCACGAAUUCGCAUUUUAUCUUUUGCAUUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UAUAGCAGUGUUUUGGCCC AC-- UUA-| U G U CU UAGUUGAGGAAAACUCCCA GC UC UCG AACUUGU UGGCU CGAA UACC \ CG AG GGC UUGAAUA ACCGA GCUU AUGG U UUUACGUUUUCUAUUUUA- CUUA CACC^ - - - -- UCUCCAUUGUUUUAGGCUG 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-314_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAACUUGUGUGGCUUCGAACUUACC -26
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-314_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
67- UAUUCGAGCCAAUAAGUUCGG -88
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000406 TargetScanFly: dme-miR-314 |
