| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-224 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-224 Cpo-Mir-224 Ete-Mir-224 Hsa-Mir-224 Mml-Mir-224 Mmu-Mir-224 Ocu-Mir-224 Rno-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrX: 119925345-119925413 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-224) |
Mir-224
chrX: 119925345-119925413 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-452-v1 chrX: 119926390-119926450 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v2 chrX: 119926391-119926447 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCGGCAGAAGAGACAAGGCCCAGGGGCUUUCAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAGUAGAUGAUUAUGCAUUGUUUCAAAAUGGUGCCCUAGUGACUGCAAAGCCCCAGAGCCAGCAUCAUCAGCAAAGUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCGGCAGAAGAGACAAG--| CCA CA U U AGUAGAUGAUU GC GGGGCUUU AGUCACUAG GGU CCGUUU A CG CCCCGAAA UCAGUGAUC CCG GGUAAA U AUGAAACGACUACUACGAC^ AGA CG - U ACUUUGUUACG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-224_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAG -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-224 miRDB: MIMAT0006744 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-224_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- AAAUGGUGCCCUAGUGACUGCAA -69
Get sequence
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