MirGeneDB ID | Bta-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-224 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-224 Cja-Mir-224 Cpo-Mir-224 Eca-Mir-224 Ete-Mir-224 Hsa-Mir-224 Laf-Mir-224 Mml-Mir-224 Mmr-Mir-224 Mmu-Mir-224 Ocu-Mir-224 Pab-Mir-224 Rno-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037357.1: 34446942-34447010 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-224) |
Mir-3431
NC_037357.1: 34445022-34445083 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-224 NC_037357.1: 34446942-34447010 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v1 NC_037357.1: 34447982-34448042 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v2 NC_037357.1: 34447983-34448039 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AAGUCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGCGGCAGGAGACAAGGCCCAUGGGCUUUCAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAGUAGAUGGUUGUACAUUGUUUCAAAAUGGUACCCUAGUGACUACAAAGCCCCAGUGGCAGCAUCAUCACCAAUGACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGCGGCAGGAGACAAG- CAU-| CA U U AGUAGAUGGUU GCC GGGCUUU AGUCACUAG GGU CCGUUU G CGG CCCGAAA UCAGUGAUC CCA GGUAAA U CAGUAACCACUACUACGA UGAC^ CA - U ACUUUGUUACA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bta-Mir-224_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAG -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-224 |
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Star sequence | Bta-Mir-224_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
46- AAAUGGUACCCUAGUGACUACAA -69
Get sequence
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