| MirGeneDB ID | Bge-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cockroach (Blattella germanica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aga-Mir-929 Dan-Mir-929 Dlo-Mir-929-v1 Dme-Mir-929 Dmo-Mir-929 Dsi-Mir-929 Dya-Mir-929 Gpa-Mir-929 Hme-Mir-929 Tca-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Bger_2.0) |
KZ620164.1: 1254-1316 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-929-v1) |
Mir-929-v1
KZ620164.1: 1254-1316 [+]
Ensembl
Mir-929-v2 KZ620164.1: 1255-1315 [+] Ensembl |
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| Variant | Bge-Mir-929-v1 |
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| Seed | AAUUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCGAUGUGAAAUUGAACUCAACCGGGGUCAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCGUAUUAUAAACAUAGUGACUCCCUAACGGAGUCAGAUUGACCUCUUUGAAGUGAACACGACGUGCGAAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGCGAUGUGAAAUUGAAC---| CC A AG CGUAUUAU UCAA GGGGUCAA UUGACUCU UAGGGAGUC \ AGUU CUCCAGUU GACUGAGG AUCCCUCAG A AGAAGCGUGCAGCACAAGUGA^ U- A CA UGAUACAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Bge-Mir-929-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAUUGACUCUAGUAGGGAGUC -22
Get sequence
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| Star sequence | Bge-Mir-929-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CUCCCUAACGGAGUCAGAUUGA -63
Get sequence
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| Variant | Bge-Mir-929-v2 |
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| Seed | AUUGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCGAUGUGAAAUUGAACUCAACCGGGGUCAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCGUAUUAUAAACAUAGUGACUCCCUAACGGAGUCAGAUUGACCUCUUUGAAGUGAACACGACGUGCGAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCGAUGUGAAAUUGAAC---| CC A AG CGUAUUAU UCAA GGGGUCAA UUGACUCU UAGGGAGUC \ AGUU CUCCAGUU GACUGAGG AUCCCUCAG A GAAGCGUGCAGCACAAGUGA^ U- A CA UGAUACAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Bge-Mir-929-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUUGACUCUAGUAGGGAGUC -21
Get sequence
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| Star sequence | Bge-Mir-929-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CUCCCUAACGGAGUCAGAUUG -61
Get sequence
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