| MirGeneDB ID | Aga-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-929-P1 Aae-Mir-929-P2 Bge-Mir-929-v1 Dan-Mir-929 Dlo-Mir-929-v1 Dme-Mir-929 Dmo-Mir-929 Dsi-Mir-929 Dya-Mir-929 Gpa-Mir-929 Hme-Mir-929 Tca-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 38209191-38209249 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUUUCUCGUGUAUGCCUACGCGUGGGAUUAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCUUUUAUACGAGCGACUCCCUAACGGAGUCAGAUUGAUUCCGGUAGUGCACCUGUCGACAGCAAGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGUUUCUCGUGUAUGCCUAC ----| A AG CCUUUUA GCG UGGGAUUAA UUGACUCU UAGGGAGU \ CGU GCCUUAGUU GACUGAGG AUCCCUCA U ACGAACGACAGCUGUCCA-- GAUG^ A CA GCGAGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Aga-Mir-929_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAUUGACUCUAGUAGGGAGU -21
Get sequence
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| Star sequence | Aga-Mir-929_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0010101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UCCCUAACGGAGUCAGAUUGA -59
Get sequence
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