Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | Br | Em | Em | He | Ve | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-9-P1 | xtr-mir-9-3 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0003649 | MIMAT0003650 | chr3 | 99283857 | 99283918 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-9-P2 | xtr-mir-9a-2 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0003553 | MIMAT0003554 | chr1 | 170225668 | 170225727 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-9-P3 | xtr-mir-9a-1 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0003553 | MIMAT0003554 | chr8 | 111349809 | 111349870 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-9-P4 | xtr-mir-9b | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0003555 | MIMAT0003556 | chr1 | 102034638 | 102034697 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all