| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-135-P1 | gmo-mir-135b | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0044053 | MIMAT0044054 | contig475703 | 148 | 205 | + | Gnathostomata | Chordata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-135-P2a | gmo-mir-135a | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0044328 | None | scaffold02980 | 68878 | 68937 | - | Clupeocephala | Chordata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-135-P2b | gmo-mir-135d | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0044259 | MIMAT0044260 | GeneScaffold_4080 | 29905 | 29964 | - | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-135-P4a | gmo-mir-135c-1 | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0044130 | MIMAT0044178 | GeneScaffold_2161 | 18287 | 18347 | - | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-135-P4b | gmo-mir-135c-2 | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0044130 | None | GeneScaffold_1609 | 1266799 | 1266861 | + | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
