MirGeneDB 3.0
63 Epimenia babai microRNA genes
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MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC To
Eba-Bantam None BANTAM GAGAUCA None None WURV02052454.1 13781 13842 + Protostomia Protostomia No 1
Eba-Let-7 None LET-7 GAGGUAG None None WURV02148338.1 2351 2417 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-1 None MIR-1 GGAAUGU None None WURV02201605.1 7089 7147 - Bilateria Bilateria No
Eba-Mir-2-o90 None MIR-2 AUCACAG None None WURV02085510.1 1105 1165 + E. babai Protostomia No 1 1
Eba-Mir-2-o91 None MIR-2 AUCACAG None None WURV02085510.1 2691 2749 + E. babai Protostomia No 1
Eba-Mir-2-o92 None MIR-2 AUCACAG None None WURV02085510.1 3976 4035 + E. babai Protostomia No 1
Eba-Mir-7 None MIR-7 GGAAGAC None None WURV02170248.1 14106 14166 + Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-8 None MIR-8 AAUACUG None None WURV02067028.1 368 430 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Eba-Mir-9 None MIR-9 CUUUGGU None None WURV02196146.1 2621 2682 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-10-P1 None MIR-10 ACCCUGU None None WURV02172575.1 1149 1206 + Bilateria Eumetazoa Unknown 1
Eba-Mir-10-P2 None MIR-10 ACCCGUA None None WURV02173183.1 438 493 + Bilateria Eumetazoa Unknown
Eba-Mir-10-P3 None MIR-10 CCCUGAG None None WURV02008596.1 3343 3405 - Bilateria Eumetazoa Unknown 1
Eba-Mir-10-P5 None MIR-10 UACCCUG None None WURV02098594.1 2279 2339 - Lophotrochozoa Eumetazoa Unknown 1
Eba-Mir-10-P6 None MIR-10 UCUCGUU None None WURV02027349.1 6543 6601 - Neotrochozoa Eumetazoa No 1
Eba-Mir-12 None MIR-12 GAGUAUU None None WURV02156550.1 15224 15281 + Protostomia Protostomia No 1 1
Eba-Mir-22-P1 None MIR-22 GCUGCCU None None WURV02168762.1 21458 21515 - Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-22-P2 None MIR-22 AGCUGCC None None WURV02168762.1 13875 13934 - Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-29-P1 None MIR-29 AGCACCA None None WURV02175023.1 11032 11092 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-29-P2 None MIR-29 AGCACCA None None WURV02010683.1 6237 6293 - Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-31 None MIR-31 GGCAAGA None None WURV02195991.1 6057 6120 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-33 None MIR-33 UGCAUUG None None WURV02104212.1 6946 7005 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-36 None MIR-36 CACCGGG None None WURV02176288.1 5998 6052 + Protostomia Protostomia Unknown
Eba-Mir-67 V None MIR-67 CACAACC None None WURV02174212.1 3905 3964 - Protostomia Protostomia 2 No 1
Eba-Mir-76 None MIR-76 UCGUUGU None None WURV02182507.1 1916 1972 - Nephrozoa Nephrozoa No 1 1
Eba-Mir-87-o29 None MIR-87 UGAGCAA None None WURV02181321.1 1231 1289 - Aculifera Protostomia No 1 1
Eba-Mir-92-o118 None MIR-92 AUUGCAC None None WURV02021373.1 1248 1307 + E. babai Bilateria No 1
Eba-Mir-92-o119 None MIR-92 AUUGCAC None None WURV02021373.1 2463 2522 + E. babai Bilateria No 1
Eba-Mir-96-P1 None MIR-96 UUGGCAC None None WURV02211831.1 14021 14078 - Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-96-P2 None MIR-96 UUGGCAC None None WURV02179177.1 7126 7184 + Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-96-P3 None MIR-96 AUGGCAC None None WURV02179177.1 4585 4641 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-124 None MIR-124 AAGGCAC None None WURV02144364.1 23194 23252 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-133 None MIR-133 UGGUCCC None None WURV02174956.1 10911 10969 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-137 None MIR-137 UAUUGCU None None WURV02021683.1 22122 22181 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-153 None MIR-153 UGCAUAG None None WURV02160368.1 2012 2068 + Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-184 None MIR-184 GGACGGA None None WURV02165094.1 1925 1982 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Eba-Mir-190 None MIR-190 GAUAUGU None None WURV02181954.1 739 798 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-193-P1 None MIR-193 ACUGGCU None None WURV02051343.1 1993 2051 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-210 None MIR-210 UGUGCGU None None WURV02149204.1 4312 4368 + Bilateria Bilateria No 1 1
Eba-Mir-216-P1 None MIR-216 AAUAUCA None None WURV02156550.1 13414 13471 + Nephrozoa Nephrozoa Unknown 1
Eba-Mir-216-P2c None MIR-216 AAUCUCA None None WURV02156550.1 14420 14477 + Lophotrochozoa Nephrozoa Unknown 1 1
Eba-Mir-219 None MIR-219 GAUUGUC None None WURV02106657.1 2641 2698 - Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-242 None MIR-242 UGCGUAG None None WURV02166278.1 1095 1153 + Nephrozoa Nephrozoa Unknown 1
Eba-Mir-252-P1 None MIR-252 UAAGUAG None None WURV02153403.1 4978 5037 + Bilateria Bilateria Unknown 1 1
Eba-Mir-252-P2 None MIR-252 UAAGUAC None None WURV02153403.1 10692 10748 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-277 None MIR-277 AAAUGCA None None WURV02156954.1 2850 2911 - Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-278 None MIR-278 CGGUGGG None None WURV02197066.1 1110 1167 + Bilateria Bilateria No 1
Eba-Mir-279 None MIR-279 GACUAGA None None WURV02185415.1 12450 12508 + Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-281 None MIR-281 GUCAUGG None None WURV02086220.1 3105 3163 - Nephrozoa Nephrozoa No
Eba-Mir-315 None MIR-315 UUUGAUU None None WURV02153879.1 4618 4675 - Nephrozoa Nephrozoa Unknown 1
Eba-Mir-317 None MIR-317 GAACACA None None WURV02151074.1 2500 2556 - Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-375 None MIR-375 UUGUUCG None None WURV02156583.1 1512 1565 - Nephrozoa Nephrozoa No
Eba-Mir-750 None MIR-750 CAGAUCU None None WURV02180942.1 3695 3748 + Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-1175 None MIR-1175 GAGAUUC None None WURV02180942.1 6833 6894 + Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-1986 None MIR-1986 GGAUUUC None None WURV02000011.1 22172 22228 + Lophotrochozoa Lophotrochozoa No 1
Eba-Mir-1990-P1 None MIR-1990 CGGGACU None None WURV02000011.1 17965 18024 + Lophotrochozoa Lophotrochozoa No 1 1
Eba-Mir-1990-P2 None MIR-1990 GGGACUA None None WURV02000011.1 21216 21272 + Lophotrochozoa Lophotrochozoa No 1
Eba-Mir-1992 None MIR-1992 CAGCAGU None None WURV02157674.1 2512 2572 + Platytrochozoa Platytrochozoa No 1 1
Eba-Mir-1993 None MIR-1993 AUUAUGC None None WURV02165590.1 982 1043 + Protostomia Protostomia No 1
Eba-Mir-1994-P1 None MIR-1994 GAGACAG None None WURV02115877.1 3888 3946 - Mollusca Lophotrochozoa No 1
Eba-Mir-1994-P2 None MIR-1994 GAGACAG None None WURV02115877.1 1576 1633 - Mollusca Lophotrochozoa No 1
Eba-Mir-2001 None MIR-2001 UGUGACC None None WURV02156569.1 3460 3519 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Eba-Mir-2722 None MIR-2722 GGCGCCG None None WURV02051454.1 7248 7310 + Mollusca Mollusca No 1
Eba-Mir-12590 None MIR-12590 CUGGCGG None None WURV02041744.1 1780 1840 - Aculifera Aculifera No 1 1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix