Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1677-P6 | None | MIR-1677 | UGACUUA | None | None | scaffold231 | 75600 | 75657 | + | Neognathae | Diapsida | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1677-P5 | cli-mir-1803-1 | MIR-1677 | UUGACUU | MIMAT0038703 | MIMAT0038704 | scaffold173 | 2790627 | 2790680 | + | Neognathae | Diapsida | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1677-P4 | cli-mir-1784 | MIR-1677 | GACUUAA | MIMAT0038699 | None | scaffold232 | 10503091 | 10503148 | - | Archelosauria | Diapsida | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1677-P2 | None | MIR-1677 | CUUUAAU | None | None | scaffold309 | 1394353 | 1394414 | + | Archelosauria | Diapsida | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1677-P1 | cli-mir-1677 | MIR-1677 | UGACUUC | MIMAT0038691 | MIMAT0038692 | scaffold1299 | 480160 | 480216 | + | Archelosauria | Diapsida | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all