MirGeneDB ID | Hsa-Mir-506-P6c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCUCAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-513c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-506-P1 Hsa-Mir-506-P2 Hsa-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P4a1 Hsa-Mir-506-P4a2 Hsa-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P5 Hsa-Mir-506-P6a1 Hsa-Mir-506-P6a2 Hsa-Mir-506-P6b Hsa-Mir-506-P7a Hsa-Mir-506-P7b Hsa-Mir-506-P7c Hsa-Mir-506-P8 Hsa-Mir-506-P9 Hsa-Mir-506-P10 Hsa-Mir-506-P11 Hsa-Mir-506-P12 Hsa-Mir-506-P13 Hsa-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P6 Cpo-Mir-506-o6 Cpo-Mir-506-P6 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Ocu-Mir-506-P6 Rno-Mir-506-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 147189717-147189774 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P6c) |
Mir-506-P6c
chrX: 147189717-147189774 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6b chrX: 147199057-147199114 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a2 chrX: 147213498-147213555 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a1 chrX: 147225860-147225917 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 147230753-147230809 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 147231002-147231059 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 147236945-147237002 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAUUCAGCCAUUCAGCGUACAGUGCCUUUCUCAAGGAGGUGUCGUUUAUGUGAACUAAAAUAUAAAUUUCACCUUUCUGAGAAGAGUAAUGUACAGCAUGCACUGCAUAUGUGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAUUCAGCCAUUCA- -| G C AG UC UGAA GC GUACA UGC UUUCUCA GAGGUG GUUUAUG C CG CAUGU AUG GAAGAGU UUCCAC UAAAUAU U UGGUGUAUACGUCACGUA A^ A A CU UU AAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-506-P6c_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCUCAAGGAGGUGUCGUUUAUG -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005789 TargetScanVert: hsa-miR-513c-5p TargetMiner: hsa-miR-513c-5p miRDB: MIMAT0005789 |
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Star sequence | Hsa-Mir-506-P6c_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0022728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UAAAUUUCACCUUUCUGAGAAGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-513c-3p TargetMiner: hsa-miR-513c-3p miRDB: MIMAT0022728 |