| MirGeneDB ID | Tni-Mir-723-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-723 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tni-Mir-723-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dre-Mir-723-P2 Gmo-Mir-723-P2 Mal-Mir-723-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
2: 3615741-3615798 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GACAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGGCUGGUCUAUAAAGGCAUGGAUAAAGGCAGUUUUGAUGAUGUCACUUCUUUUAUUUUAAGAAGACAUCAGAUAAAUCUGUGCUUAUCCUUGUUGAGAUAUACGUACCCUCCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGGCUGGUCUAUAAA-- U AG U A-| AC UUUUA GGCA GGAUAA GCAG UUUG UGAUGUC UUC \ UUGU CCUAUU UGUC AAAU ACUACAG AAG U CUCCUCCCAUGCAUAUAGAG U CG U AG^ -- AAUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tni-Mir-723-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGCAGUUUUGAUGAUGUCACUUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Tni-Mir-723-P2_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AGACAUCAGAUAAAUCUGUGCU -58
Get sequence
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