MirGeneDB ID | Gmo-Mir-723-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-723 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cod (Gadus morhua) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | gmo-mir-723-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Gmo-Mir-723-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dre-Mir-723-P2 Mal-Mir-723-P2 Tni-Mir-723-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Gadus_morhua.gadMor1.dna.toplevel) |
GeneScaffold_830: 246018-246077 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GACAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGCACCGGGGACGAUAGAGUUACGGAUAAAGGCAGUUUUUAAUGAUGUUACUUCUUUUUACUCAUAGAAGACAUCAGAUAAAUCUGUGCUUAUCCUUGCUCAUGAAACGAUGCCCUCCUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AGCACCGGGGACGAUAG---| UAC AG U UAA UA UUUUU AGU GGAUAA GCAG UUU UGAUGU CUUC A UCG CCUAUU UGUC AAA ACUACA GAAG C CUCCUCCCGUAGCAAAGUAC^ UU- CG U UAG -- AUACU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Gmo-Mir-723-P2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGCAGUUUUUAAUGAUGUUACUUC -24
Get sequence
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Mature sequence | Gmo-Mir-723-P2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0044007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AGACAUCAGAUAAAUCUGUGCU -60
Get sequence
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