| MirGeneDB ID | Snu-Mir-1997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1997 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Peanut worm (Sipunculus nudus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cte-Mir-1997 Dgr-Mir-1997 Efe-Mir-1997-P1 Efe-Mir-1997-P2 Efe-Mir-1997-P3 Efe-Mir-1997-P4 Efe-Mir-1997-P5 Pdu-Mir-1997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Sipuncula + Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Sipuncula + Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_026874595.1_ASM2687459v1_Sipunculus_nudus) |
CM049322.1: 34244559-34244617 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGCAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAUACCUUGAAAGAAGCGCCAGGCUGUGGGGUUGAUGGUUCCAUGCAAAGUCUUAAAUACUGGAACUCUGCAGGUUCACAUCAGCCCCGGAGAGUGGCUUUAUCACACCUGCGUGGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAUACCUUGAAAGAAGC-- GG G GUU-| A A CUUAAA GCCA CU UGGGGUUGAUG CC UGCA AGU \ CGGU GA GCCCCGACUAC GG ACGU UCA U GAGGUGCGUCCACACUAUUU GA G ACUU^ - C AGGUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Snu-Mir-1997_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGUUGAUGGUUCCAUGCAAAGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Snu-Mir-1997_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCUGCAGGUUCACAUCAGCCCC -59
Get sequence
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