MirGeneDB ID | Pab-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9851 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-9851 Cfa-Mir-9851 Eca-Mir-9851 Ete-Mir-9851 Hsa-Mir-9851 Laf-Mir-9851 Mml-Mir-9851 Mmr-Mir-9851 Ocu-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054687.2: 123874932-123874988 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGUGACAUGGCAGCGGUGGUGAGCCCGGCGCUGGCAGUGUUGGUGACACUCACGUGGUGGUGGUGGCAUCAGCACUGGUGAUGUCUGUACCAGCAGGAGAGGUAGCACCGGCACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCAGUGACAUGGCAGCGG-----| AGCCC CU G A CACGU UGGUG GGCG G CAGUGUUGGUG CACU \ ACCAU CUGU U GUCACGACUAC GUGG G CCACGGCCACGAUGGAGAGGACG^ GU--- AG G G UGGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pab-Mir-9851_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCUGGCAGUGUUGGUGACACU -22
Get sequence
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Mature sequence | Pab-Mir-9851_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGGCAUCAGCACUGGUGAUGUC -57
Get sequence
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