MirGeneDB ID | Hsa-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9851 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-9851 Cfa-Mir-9851 Eca-Mir-9851 Ete-Mir-9851 Laf-Mir-9851 Mml-Mir-9851 Mmr-Mir-9851 Ocu-Mir-9851 Pab-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr10: 116827499-116827555 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGUGACAUGGCAGUGGCGGUGAGCCUGGCGCUGGCAGUGUUGGUGACACUCACGUGGUGGUGGUGGCACCAGCACUGGCGGUGUCUGUACCAGCAGGAGAGGUAGCACCGACACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCAGUGACAUGGCAGUG---- -| AGCCU G A CACGU GC GGUG GGCGCUG CAGUGUUGGUG CACU \ CG CCAU CUGUGGC GUCACGACCAC GUGG G CCACAGCCACGAUGGAGAGGA A^ GU--- G G UGGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | No reads are yet reported from human and the entry is not in MirBase v. 22. However the locus is clearly present in the human genome and the reads are derived from rabbit and pig. This gene is annotated on Ensembl (assembly GRCh38.p2) as gene AC023283.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-9851_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCUGGCAGUGUUGGUGACACU -22
Get sequence
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Mature sequence | Hsa-Mir-9851_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGGCACCAGCACUGGCGGUGUC -57
Get sequence
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