MirGeneDB ID | Laf-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9851 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-9851 Cfa-Mir-9851 Eca-Mir-9851 Ete-Mir-9851 Hsa-Mir-9851 Mml-Mir-9851 Mmr-Mir-9851 Ocu-Mir-9851 Pab-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010037.1: 2394607-2394663 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCGACGUGGCAGCAGAGGCGGUGAGCCCGGCGCUGGCAGUAUUGGUGGCACUUGCAUGGUGGCAGUGGCACCAGCACUGGCGGUGGCGGUGGCACCAGCACUGGCGGCGCCUAUACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GCGACGUGGCAGCAGAG- -| AGC G G A G UGCAU GC GGUG CCG CGCUG CAGU UUGGUG CACU \ CG CCAC GGC GUGGC GUCA GACCAC GUGA G CCAUAUCCGCGGCGGUCA A^ GGU G G C G CGGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Laf-Mir-9851_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCUGGCAGUAUUGGUGGCACU -22
Get sequence
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Mature sequence | Laf-Mir-9851_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGGCACCAGCACUGGCGGUGGC -57
Get sequence
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