MirGeneDB ID | Mml-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9851 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-9851 Cfa-Mir-9851 Eca-Mir-9851 Ete-Mir-9851 Hsa-Mir-9851 Laf-Mir-9851 Mmr-Mir-9851 Ocu-Mir-9851 Pab-Mir-9851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014344.1: 117318291-117318347 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGUGACAUGGCAGUGGCGGUGAGCCCAGCACUGGCAGUGUUGGUGACACUCAUGUGGUGGUGGUGGCACCAGCACUGGCAGUGUCUGUACCAGCAGGAGAGGUAGCACCAGCACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCAGUGACAUGGCAGUG---- -| AGCC - G A CAUGU GC GGUG CAG CACUG CAGUGUUGGUG CACU \ CG CCAU GUC GUGAC GUCACGACCAC GUGG G CCACGACCACGAUGGAGAGGA A^ ---- U G G UGGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-9851_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CACUGGCAGUGUUGGUGACACU -22
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-9851_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGGCACCAGCACUGGCAGUGUC -57
Get sequence
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