| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-432 Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Dno-Mir-432 Eca-Mir-432 Ete-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Mmr-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chrUn0352: 9852-9920 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-337-as
chrUn0352: 1560-1620 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v1 chrUn0352: 1562-1622 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chrUn0352: 1562-1622 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chrUn0352: 6784-6857 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chrUn0352: 7903-7958 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chrUn0352: 9852-9920 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chrUn0352: 10072-10127 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chrUn0352: 10072-10127 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chrUn0352: 31816-31871 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCGUGAGCCGUUGCAUGACUCCUCCAGGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUCUAAUUCCUUACGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGAUCAGUGGGCAGCUCUUCCAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCGUGAGCCGUUGCA- -| C UCU UA G AUCCUCUAAU UGA CU CUCCAGG UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACU GA GAGGUUC ACCUC UCGGUAG UCACC C UUACCUUCUCGACGGGUG A^ U UGU C- G GGGUGCAUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-432_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGG -23
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-432_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCU -69
Get sequence
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