| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-675 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-675 Cja-Mir-675 Cpo-Mir-675 Dno-Mir-675 Eca-Mir-675 Hsa-Mir-675 Laf-Mir-675 Mml-Mir-675 Mmr-Mir-675 Neu-Mir-675 Pab-Mir-675 Rno-Mir-675 Sha-Mir-675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 142577078-142577133 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGUAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUUCCCAUGAGGCACUGCGGCCCAGGGACUGGUGCGGAAAGGGCCCACAGUGGACUUGGUACACUGUAUGCCCUAACCGCUCAGUCCCUGGGUCUGGCAUGACAGACAGAACAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAUUCCCAUGAGGCACUGC--| U AA CC GACU GGCCCAGGGACUGG GCGG AGGGC ACAGUG \ CUGGGUCCCUGACU CGCC UCCCG UGUCAC U UUACAAGACAGACAGUACGGU^ - AA UA AUGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-675_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0003725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGUGCGGAAAGGGCCCACAGUG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003725 TargetScanVert: mmu-miR-675-5p miRDB: MIMAT0003725 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-675_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CUGUAUGCCCUAACCGCUCAGU -56
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003726 miRDB: MIMAT0003726 |
