| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-186 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-186 Cfa-Mir-186 Cja-Mir-186 Cpo-Mir-186 Dno-Mir-186 Eca-Mir-186 Ete-Mir-186 Hsa-Mir-186 Laf-Mir-186 Mdo-Mir-186 Mml-Mir-186 Mmr-Mir-186 Neu-Mir-186 Oan-Mir-186 Ocu-Mir-186 Pab-Mir-186 Rno-Mir-186 Sha-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr3: 157544285-157544345 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCCCAAACAUUUAAUUGCUUACAACUUUCCAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUUUCUCAUUUUAUUUUAAGCCCUAAGGUGAAUUUUUUGGGAAGUUUGAGCUAAAUGCCUUCAACUAAAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUCCCAAACAUUUAAUU---| C U UU UCUCAU GCUUA AACUUUCCAAAGAAUUC CCUU GGGCUU U CGAGU UUGAAGGGUUUUUUAAG GGAA CCCGAA U AAAAAUCAACUUCCGUAAAU^ - U U- UUUUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-186_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000215 TargetScanVert: mmu-miR-186-5p miRDB: MIMAT0000215 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-186_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- GCCCUAAGGUGAAUUUUUUGGG -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004540 TargetScanVert: mmu-miR-186-3p miRDB: MIMAT0004540 |
