MirGeneDB ID | Hsa-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-186 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-186 Cfa-Mir-186 Cja-Mir-186 Cpo-Mir-186 Dno-Mir-186 Eca-Mir-186 Ete-Mir-186 Laf-Mir-186 Mdo-Mir-186 Mml-Mir-186 Mmr-Mir-186 Mmu-Mir-186 Neu-Mir-186 Oan-Mir-186 Ocu-Mir-186 Pab-Mir-186 Rno-Mir-186 Sha-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr1: 71067642-71067702 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAAACAUUUUUUCAUUGCUUGUAACUUUCCAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUUUCUGGUUUUAUUUUAAGCCCAAAGGUGAAUUUUUUGGGAAGUUUGAGCUAAAUUCCUUCAACCAAAAUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CCAAACAUUUUUUCAUU---| U U U UCUGGU GCUUG AACUUUCCAAAGAAUUC CCUUU GGGCUU U CGAGU UUGAAGGGUUUUUUAAG GGAAA CCCGAA U UAAAACCAACUUCCUUAAAU^ - U - UUUUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-186_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000456 TargetScanVert: hsa-miR-186-5p TargetMiner: hsa-miR-186-5p miRDB: MIMAT0000456 |
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Star sequence | Hsa-Mir-186_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- GCCCAAAGGUGAAUUUUUUGGG -61
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004612 TargetScanVert: hsa-miR-186-3p TargetMiner: hsa-miR-186-3p miRDB: MIMAT0004612 |