| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1247 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1247-v1 Cfa-Mir-1247 Cja-Mir-1247 Cpo-Mir-1247 Dno-Mir-1247 Eca-Mir-1247-v1 Ete-Mir-1247 Hsa-Mir-1247 Laf-Mir-1247 Mml-Mir-1247 Mmr-Mir-1247 Ocu-Mir-1247 Pab-Mir-1247 Rno-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr12: 110278058-110278115 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCCGUCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCGCCCGGCGCAGCCCCGGCCGCCGGGCGCACCCGUCCCGUUCGUCCCCGGACGUUGCUCUCUGCCCCGGGAACGUCGAGACUGGAGCGCCCGAACUGAGCCACCUUCGCGAACUCGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCGCCCGGCGCAGCCCCGGCCGC--| A C C UU C ACGUUGC CGGGCGC CC GUC CG CGU CCCGG \ GCCCGCG GG CAG GC GCA GGGCC U GGCUCAAGCGCUUCCACCGAGUCAA^ A U A U- A CCGUCUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1247_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCCGUCCCGUUCGUCCCCGGA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1247-5p miRDB: MIMAT0014800 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1247_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CGGGAACGUCGAGACUGGAGC -58
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1247-3p miRDB: MIMAT0014801 |
