| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-1911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1911 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1911 Cfa-Mir-1911 Cja-Mir-1911 Eca-Mir-1911 Hsa-Mir-1911 Mml-Mir-1911 Ocu-Mir-1911 Pab-Mir-1911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 42669472-42669530 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1911) |
Mir-1298
CM007693.1: 42645967-42646040 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1911 CM007693.1: 42669472-42669530 [+] UCSC Ensembl Mir-448 CM007693.1: 42708386-42708465 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GAGUACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGCAUCCAUCAUCAUUCGCUGGGCAUCUGCUGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGGCAUCCACAGUCUCCCACCAGGCAUUGUGGUCUCCGCUGAUGCUCUGCCAUUUCACCACCAGUGCCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGCAUCCAUCAUCAUUC--| U U U U C U CAUCC GC GGGCAUC GC GAG ACCGC AUGUCUG UGGG A CG CUCGUAG CG CUC UGGUG UACGGAC ACCC C UCCGUGACCACCACUUUAC^ U U C - U C UCUGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-1911_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGG -23
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-1911_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACCAGGCAUUGUGGUCUCCGC -59
Get sequence
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