MirGeneDB ID | Lpo-Mir-8-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-8 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAUACUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Lpo-Mir-8-P8 Lpo-Mir-8-P9 Lpo-Mir-8-P10 Lpo-Mir-8-P11 Lpo-Mir-8-P12 Lpo-Mir-8-P13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-8 Asu-Mir-8 Bge-Mir-8 Bpl-Mir-8 Cbr-Mir-8 Cel-Mir-8 Cgi-Mir-8 Csc-Mir-8 Cte-Mir-8 Dan-Mir-8 Dma-Mir-8 Dme-Mir-8 Dmo-Mir-8 Dpu-Mir-8 Dsi-Mir-8 Dya-Mir-8 Esc-Mir-8 Hme-Mir-8 Isc-Mir-8 Lan-Mir-8 Lgi-Mir-8 Npo-Mir-8 Obi-Mir-8 Ovu-Mir-8 Pfl-Mir-8 Pmi-Mir-8 Sko-Mir-8 Spu-Mir-8 Tca-Mir-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013666477.1: 82418-82477 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAAGCUUUUGAUUGACAGGUUCUCAGAAACAUCUUACCAGGCAGCAUUAGAUUGAAAAAUAAUUUCUAAUACUGUCAGGUAAAGAUGUCUAUGGAGUCUGCGAAUGCAGCGUCAUCUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAAAGCUUUUGAUUGAC---| GU U GAA - A C AUUGAAA AG UC CA ACAUCUU ACC GGCAG AUUAG \ UC AG GU UGUAGAA UGG CUGUC UAAUC A GGUCUACUGCGACGUAAGCG^ UG - AUC A A A UUUAAUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Lpo-Mir-8-P7_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUCUUACCAGGCAGCAUUAG -21
Get sequence
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Mature sequence | Lpo-Mir-8-P7_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAAUACUGUCAGGUAAAGAUGUC -60
Get sequence
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