MirGeneDB ID | Laf-Mir-362-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-362 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Laf-Mir-362-P1 Laf-Mir-362-P4 Laf-Mir-362-P6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ocu-Mir-362-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010083.1: 348733-348792 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P2) |
Mir-362-P6
GL010083.1: 316274-316333 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-188-P3 GL010083.1: 317651-317709 [-] UCSC Ensembl Mir-362-P4 GL010083.1: 323100-323158 [-] UCSC Ensembl Mir-362-P2 GL010083.1: 348733-348792 [-] UCSC Ensembl Mir-362-P1 GL010083.1: 349059-349115 [-] UCSC Ensembl Mir-188-P1 GL010083.1: 353164-353224 [-] UCSC Ensembl Mir-188-P2 GL010083.1: 353531-353589 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUGUACC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUUAGUCCUUCUCAUUUGCUCCUUCUCUCUAAUCCUUGGUACCUGGUGGUAGUGCUUUCUAAAUGCAAUGUACCUGGGCAAGGAUUCAGAGCGGGGGAUGAGCUUUAUCUGCAGAUGGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUUAGUCCUUCUCAUUUGC- U -| GUA U GUAG UUUC UCCUUC CUCU AAUCCUUG CC GGUG UGC \ AGGGGG GAGA UUAGGAAC GG CCAU ACG U AGGUAGACGUCUAUUUCGAGU C C^ G-- U GUA- UAAA . 110 100 90 80 70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Laf-Mir-362-P2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAUCCUUGGUACCUGGUGGUAGUGC -26
Get sequence
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Mature sequence | Laf-Mir-362-P2_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAUGUACCUGGGCAAGGAUUCAG -60
Get sequence
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