| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-154-P24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-154 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hsa-Mir-154-P1 Hsa-Mir-154-P2-v1 Hsa-Mir-154-P3-v1 Hsa-Mir-154-P4 Hsa-Mir-154-P5 Hsa-Mir-154-P6a-v1 Hsa-Mir-154-P6b Hsa-Mir-154-P7 Hsa-Mir-154-P8a Hsa-Mir-154-P8b Hsa-Mir-154-P9 Hsa-Mir-154-P10 Hsa-Mir-154-P11 Hsa-Mir-154-P12 Hsa-Mir-154-P14 Hsa-Mir-154-P16a Hsa-Mir-154-P16b Hsa-Mir-154-P17 Hsa-Mir-154-P18 Hsa-Mir-154-P19 Hsa-Mir-154-P20 Hsa-Mir-154-P21 Hsa-Mir-154-P23 Hsa-Mir-154-P25 Hsa-Mir-154-P26 Hsa-Mir-154-P28-v1 Hsa-Mir-154-P29 Hsa-Mir-154-P30 Hsa-Mir-154-P31 Hsa-Mir-154-P32 Hsa-Mir-154-P33 Hsa-Mir-154-P34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-154-P24 Cfa-Mir-154-P24 Cja-Mir-154-P24 Cpo-Mir-154-P24 Dno-Mir-154-P24 Eca-Mir-154-P24 Ete-Mir-154-P24 Laf-Mir-154-P24 Mml-Mir-154-P24 Mmr-Mir-154-P24 Mmu-Mir-154-P24 Ocu-Mir-154-P24 Pab-Mir-154-P24 Rno-Mir-154-P24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chr14: 101054316-101054373 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-154-P24) |
Mir-154-P1
chr14: 101022071-101022129 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-154-P2-v2 chr14: 101023339-101023396 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P2-v1 chr14: 101023340-101023395 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P3-v1 chr14: 101023799-101023853 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P3-v2 chr14: 101023800-101023852 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P4 chr14: 101025020-101025076 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P5 chr14: 101025585-101025640 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P6a-v1 chr14: 101025747-101025802 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P6a-v2 chr14: 101025747-101025802 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P7 chr14: 101026035-101026092 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P8a chr14: 101026796-101026855 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P8b chr14: 101027113-101027172 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P9 chr14: 101029648-101029703 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P10 chr14: 101030064-101030120 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P11 chr14: 101031997-101032054 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P12 chr14: 101033768-101033825 [+] UCSC Ensembl Mir-376-P1 chr14: 101039358-101039415 [+] UCSC Ensembl Mir-376-P2 chr14: 101039695-101039752 [+] UCSC Ensembl Mir-376-P3 chr14: 101040081-101040138 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P14 chr14: 101040234-101040289 [+] UCSC Ensembl Mir-376-P4 chr14: 101040460-101040517 [+] UCSC Ensembl Mir-376-P5 chr14: 101040788-101040845 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P16a chr14: 101042991-101043050 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P16b chr14: 101044212-101044271 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P17 chr14: 101045927-101045989 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P18 chr14: 101046469-101046526 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P19 chr14: 101047329-101047392 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P20 chr14: 101047911-101047969 [+] UCSC Ensembl Mir-544 chr14: 101048676-101048732 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P21 chr14: 101049572-101049631 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P23 chr14: 101052458-101052515 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P24 chr14: 101054316-101054373 [+] UCSC Ensembl Mir-134 chr14: 101054694-101054754 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P25 chr14: 101055427-101055485 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P6b chr14: 101056233-101056289 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P26 chr14: 101059769-101059826 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P28-v2 chr14: 101060595-101060650 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P28-v1 chr14: 101060596-101060649 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P29 chr14: 101062056-101062115 [+] UCSC Ensembl Mir-541 chr14: 101064504-101064569 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P30 chr14: 101065314-101065367 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P31 chr14: 101065465-101065519 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P32 chr14: 101065606-101065661 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P33 chr14: 101065925-101065981 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P34 chr14: 101066731-101066786 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGUCUCUGCUUUUCUGUGGUACUUGAAGAGAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCGCUUUACUUAUGACGAAUCAUUCACGGACAACACUUUUUUCAGUACCAAAUGCUACCUCUAAGGACUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUGUCUCUGCUUUUCUG--| U A- UG CUUUA UGGUACU GAAGAGA GUUGUUCGUGG GAUUCG C ACCAUGA CUUUUUU CAACAGGCACU CUAAGC U UCAGGAAUCUCCAUCGUAA^ - CA UA AGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Hsa-Mir-154-P24_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0000737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000737 TargetScanVert: hsa-miR-382-5p TargetMiner: hsa-miR-382-5p miRDB: MIMAT0000737 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Hsa-Mir-154-P24_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0022697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAUCAUUCACGGACAACACUUU -58
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-382-3p TargetMiner: hsa-miR-382-3p miRDB: MIMAT0022697 |
