MirGeneDB ID | Hme-Mir-33-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-33 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hme-mir-33-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hme-Mir-33-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-33 Aga-Mir-33 Ava-Mir-33 Bge-Mir-33 Cin-Mir-33 Csc-Mir-33 Cte-Mir-33 Dan-Mir-33 Dgr-Mir-33 Dlo-Mir-33 Dma-Mir-33 Dme-Mir-33 Dmo-Mir-33 Dpu-Mir-33 Dsi-Mir-33 Dya-Mir-33 Eba-Mir-33 Ebu-Mir-33 Efe-Mir-33 Egr-Mir-33 Esc-Mir-33 Gpa-Mir-33 Gsp-Mir-33 Hru-Mir-33 Isc-Mir-33 Lgi-Mir-33 Llo-Mir-33 Mgi-Mir-33 Mom-Mir-33 Npo-Mir-33 Obi-Mir-33 Ofu-Mir-33 Ovu-Mir-33 Pau-Mir-33 Pca-Mir-33 Pcr-Mir-33 Pdu-Mir-33 Pfl-Mir-33 Pmi-Mir-33 Sko-Mir-33 Snu-Mir-33 Spu-Mir-33 Tca-Mir-33 War-Mir-33 Xbo-Mir-33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Hmel_1) |
HE671035: 83696-83756 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGCAUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUAUUAUUUGAAGACAAACUAUUGCGAGAGUGCAUUGUAGUUGCAUUGCACUUGUUAUUUAUUAUGUGCAAUAUUUCUACAAAGCAAAUCUCGCUCUAGUUGCUUUCGUCAUACAUACGUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UAUAUUAUUUGAAGACA-- UU G-| A UUGC CUUGUUA AACUA GCGAGA UGC UUGUAG AUUGCA U UUGAU CGCUCU ACG AACAUC UAACGU U UGCAUACAUACUGCUUUCG CU AA^ A UUUA GUAUUAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hme-Mir-33-P9_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0024980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUGCAUUGUAGUUGCAUUGCA -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hme-Mir-33-P9_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CAAUAUUUCUACAAAGCAAAUC -61
Get sequence
|