| MirGeneDB ID | Dno-Mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-590 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-590 Cfa-Mir-590 Eca-Mir-590 Hsa-Mir-590 Mml-Mir-590 Mmr-Mir-590 Oan-Mir-590 Ocu-Mir-590 Pab-Mir-590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568462: 169015-169075 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUUUUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCCUAAAAGUCCCAUAGCCAAUCCGAAAUGAGCGUAUUCAUAAAAUUACAGUAUAAUCCAGCUAGCCUGUAAUUUUAUGUAUAAACUAGUCUCUGAUUGAAACAUGCAACAAAUGUCUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCCUAAAAGUCCCAUAGC--| C A G CG U UAUAAUC CAAUC GA AU AG UAU CAUAAAAUUACAG \ GUUAG CU UG UC AUA GUAUUUUAAUGUC C CUUCUGUAAACAACGUACAAA^ U C A AA U CGAUCGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-590_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGCGUAUUCAUAAAAUUACAG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-590_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAAUUUUAUGUAUAAACUAGU -61
Get sequence
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