MirGeneDB ID | Dno-Mir-1343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1343 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-1343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1343 Cfa-Mir-1343 Cja-Mir-1343 Cpo-Mir-1343 Eca-Mir-1343 Hsa-Mir-1343 Laf-Mir-1343 Ocu-Mir-1343 Pab-Mir-1343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH578552: 1379019-1379078 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCUAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGCGGGGCAAUGAUGCUGGCGUCGGUGCUGGGGAGCGGCCCCCGGGGUGGCCCAUCGCUCCGGCCCCUCCUAGGGCCGGCACUCUUGCUGCGGGCCGGCUCCACGUCAGCCACCGACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGAGCGGGGCAAUGAUG--- G GU U A - CC---| UGGCCCA CUGGC UCG GC GGGG G CGGCCC GGGG U GGCCG GGC CG UCUC C GCCGGG CCCC C ACAGCCACCGACUGCACCUC - GU U A G AUCCU^ GGCCUCG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-1343_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGGGAGCGGCCCCCGGGGUG -21
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-1343_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CUCCUAGGGCCGGCACUCUUGC -60
Get sequence
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